L'UCL offre sur ses fonds propres des bourses de spécialisation médicale et des bourses de mise à niveau (bourses dites "de perfectionnement scientifique") aux anciens diplômés de troisième cycle de l'UCL ou aux chercheurs d'une université d'un pays en voie de développement ayant eu des collaborations avec l'UCL.
Par ailleurs, certains bailleurs de fonds octroient des bourses de stage :
- Commission Universitaire pour le Développement (CUD)
- Direction Générale de la Coopération au Développement des Affaires étrangères) (DGD)
- Agence Universitaire de la Francophonie (AUF)
- Union européenne
